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오염이 된 것인지를 판단할 수 있을 것이다. 종 내에는 다양한 strain이 있으며, 일부가
substitution되어 염기서열 확인 시 산물의 크기가 조금 차이가 있을 수 있다.
[TACCACGCCCCCTTGT]AAATAATTTTAAACAGGAGGTGTGTTTGATTGTTTATGGTGATGATAATTTAATTTCTA
TTAAGCCGGACACCATGAAATATTTTAATGGTGAGCAAATTAAAACCATTCTGGCTAAATATAAAGTTACCATTA
CTGATGGCAGTGATAAGAACTCACCTGTTCTTAGAGCCAAACCCTTGAAACAGCTCGATTTTTTGAAGAGAGGT
TTCAGGGTTGAAAGTGATGGGAGGGTGCTTGCCCCTTTAGATTTGCAAGCTATCTATTCTTCCCTGTATTATATT
AATCCGCAGGGAAATATATTAAATTCTTTGTTTTTGAATGCTCGAGTCGCTTTGAGAGAGTTATATCTCCATGGC
GATGTTGAGCAATTTACTGCTGTCAGGAATTTTTACGTCAAGCAAATTGGCGGAAATTTCTTGAGTCTACCCCA
GTGGAGGCACTGCGCTTCGTTCCATGATGAACAATATTCTCAGTGGAAGCCGTGGTCCCCCGTTAAATTCTTGG
AGGTA[GATGTGCCCGATGCTAAATTTT]
그림 9. ToRSV 진단용 primer set 1 (N120 / C20, 549 bp)의 염기서열
[ ], Primer binding site
[GACGATTCCCTCCGGTAGTTATGC]AGACGTGTATAATGCGCGCAACATGACACGCGTTTTCCGCCCACAATCT
GTACAGGGTTCTTCTTTGGCGGAAGCGCAATTTAATGAATCGCACGCTGTGAATATGCTAGTGCGAATTGATTT
ACCTGATGGCAACATTATTTCTGCCTGCAGGTTTCGCGGGAAGTCTTTGGCTTTGACTAAACATCAGGCCTTAA
CCATACCGCCAGGTGCTAAAATCCATATTGTATATACTGACAACAATGGAAATACTAAAGCACCTCTGACCCAT
TTTTTCCAACCTACTGGACCTAATGGAGAACGTTTTTTGAGATTCTTCAACGGGACAGAGGTTTGTATTTATTCT
CACCCTCAACTTTCAGCTTTGCCTGGCGCTCCACAAAACTATTTTTTGAAAGATGTGGAGAAAATATCTGGTGA
CATAGCCATTAAAGGTTGTGGCATCAAGCTAGGTAGAACTAGCGTTGGCGAGTGTGTTGGTGTTAAGGACAAT
GAACCCGTCTTAAATCACTGGCGCGCTGTCGCGAAGGTTCGCACCACCAAGATCACTATCGACAATTATGCAG
AGGGTGGTGATTATTCCAATGATCTTCCTACGTCCATCATCTCTGAGTATGTAAATTCACCAGAAGATTGTGGC
GCGCTTTTAGTCGCCCATCTT[GAAGGTGGTTACAAAATCATAGGG]
그림 10. ToRSV 진단용 primer set 2 (N80 / C60, 709 bp)의 염기서열
[ ], Primer binding site
그림 11. ToRSV 진단용 primer 구간을 포함하는 양성대조
구의 산물과 최종 선발된 primer set의 PCR 결과
식물검역바이러스 검사법 ? 395

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