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그림 2. TRSV 진단을 위해 설계한 primer 지도
표 2. TRSV 종 공통염기서열로부터 설계한 진단용 primer 정보
Primer name
Sequence
Length (bp)
Location*
TRSV­N10
GTTGTTCCCGATCCCACTTGTTG
23
1,896­1,918
TRSV­N12
CCCAAAGATGCGAAGAAAGGAA
22
1,941­1,962
TRSV­N20
GTCTATAGCGTGCACCTTTGATGA
24
2,102­2,125
TRSV­N30
TCCGAGATGTTTGAACTGCCTACC
24
2,173­2,195
TRSV­N40
CATTGATCGTTTTGAGTTAGTTCC
24
2,393­2,416
Forward
TRSV­N50
GGAGGTCCCGTCAAGCATTCTAA
23
2,532­2,554
TRSV­N60
TCAGATAATGCACGGAGATGG
21
2,729­2,749
TRS­N40
ACTGAAGAAGGGTTTGGTAGACT
23
2,796­2,818
TRSV­N70
ACTTGGCGACCCGACTCTCAG
21
2,895­2,915
TRSV­N80
CCAGGCTCAGGAGGGTAGTGTT
22
3,155­3,176
TRS­C10
GCCCCAAACCAAATATGAACAGTG
24
3,870­3,893
TRSV­C10
GTTTTCACTTGTGCCCAGGAGAG
23
3,808­3,830
TRSV­C20
GGCTCTCACCCCCAAAAAG
19
3,736­3,754
TRSV­C30
ATCCGGACATAGTTTTGCTTACCC
24
3,411­3,434
TRSV­C40
CCTGGGCCTGTTTGGACCTT
20
3,140­3,159
TRSV­C50
AGCGTCACAGTTGCGTCCTTAGAG
24
3,138­3,161
Reverse
TRSV­C60
CCGCACTAGAAAACATGGGAGGAT
24
2,920­2,943
TRS­C30
TGGCCATCTCCGTGCATTATCTGA
24
2,729­2,752
TRSV­C70
CTTCCGCTTATAGTGCCAGACCA
23
2,604­2,626
TRSV­C80
TAACTGCCCGGGAATATGAAATGG
24
2,563­2,586
TRSV­C90
GCCAATCAGCAGCCATCGTC
20
2,336­2,355
TRS­C40
GCCAATCAGCAGCCATCGTCACTT
24
2,332­2,355
*
Genebank accession number AY363727을 기준으로 작성
식물검역바이러스 검사법 ? 399

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