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8. 송아지 설사와 관련된 바이러스성 원인체에 대한 유전자 검사법
1) 핵산 추출키트를 이용하여 분변에서 DNA/RNA 추출
2) BVDV, Rotavirus, Coronavirus는 가축방역사업용 진단액을 사용
3) Norovirus와 Torovirus는 nested PCR을 이용, Kobuvirus는 일반 PCR을 이용
Target
Product
PCR
Primer sequences
Ref
gene
size(bp)
conditions
GGCATATGCCCWTAGTAGGACTAGC
BVD
287
AGTTGCAACTCCATGTGCMATGTAC
특허출원
(10-2008-
45℃ 30m → 95℃ 5m →
0116959)
AAGCCGGCTTTAAAAGAGAGAAT
40 cycles (95℃ 30s,
Rota
392
GGATCGAWCCWGTYGGCCAYCCYT
58℃1m, 72℃, 1m) →72℃
*가축방역 사업
10m
용진단액
(인트론)
GCACCACTTCTGGTAGTAATGA
Corona
660
CAGCATCCCCATGATTGATATC
45℃ 30m → 94℃ 5m →
J Gen Virol
GATGCTCCTCGGTGGTCTCA
35 cycles (94℃ 45s,
(2003)
Kobu
631
GTCGGGGTCCATCACAGGGT
56℃45s, 72℃1m)→72℃
84(11):
10m
3069-77
45℃ 30m → 94℃ 5m →
AGTTAYTTTTCCTTYTAYGGBGA
35 cycles (94℃ 1m,
1st
532
AGTGTCTCTGTCAGTCATCTTCAT
48℃1m, 72℃2m) →72℃
Vet Micro
7m
Noro
(2007)
124: 125-133
94℃ 5m → 30 cycles
GTCGACGGYCTKGTSTTCCT
2nd
325
(94℃ 1m, 50℃ 1m,
CACAGCGACAAATCATGAAA
72℃ 2m) → 72℃ 7m
45℃ 30m → 94℃ 10m →
Microbiol
TTCTTACTACACTTTTTGGA
1st
603
35 cycles (94℃ 1m, 49℃
(2003)
ACTCAAACTTAACACTAGAC
1m, 72℃2m) →72℃10m
41:3089-99
Toro
94℃ 10m → 35 cycles
TATGTACTATGTTTCCAGCT
Unpublished
2nd
409
(94℃ 1m, 49℃ 1m,
CCAACACAAATCCGCAACGC
data
72℃ 2m) → 72℃ 10m
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