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(MLVA) 기법을 확립함.(Fig 1)
연
? 동일한 68주에 대한 기존의 PFGE(23 pattern)와 MLVA(26 profile) 기법의 유전자형
구
감별의 유용성 정도를 평가하기 위하여 diversity index(DI) 값을 구하였으며, 이를 바
성
탕으로 가금티푸스균의 유전자형 분석에 MLVA(0.918)를 병행할 경우 PFGE(0.874)의
과
균주감별력을 개선할 수 있음을 확인함.(Fig 1)
활
용
집
Similarity
Strain
Year
Source
rpoS allele
M LVA
100
70
75
80
85
90
95
SG03246
2003
layer
3
23
SG04D251
2004
broiler
1
20
SG04D262
2004
broiler
1
20
SG05D068
2005
layer
1
20
SG09L018
2009
broiler
1
9
SG08L20
2008
broiler
1
5
SG08L023
2008
layer
1
13
SG09YHS73W
2009
layer
1
12
SG03063
2003
layer
1
13
SG03114
2003
native
2
13
SG05D103
2005
broiler
1
20
SG09KJM-SR-N6
2009
layer
1
13
SR2-N6
-
-
1
13
SG04D254
2004
layer
10
19
SG07Q083
2007
native
1
25
SG08D227
2008
layer
1
26
SG08Q651
2008
layer
1
20
8 profiles
SG02267
2002
broiler
1
12
SG05Q056
2005
broiler
1
12
/ 12 strains
SG06Q110
2006
breeder
1
24
SG08L017
2008
native
1
13
SG09PJYL6
2009
layer
1
20
SG09PJS1L
2009
layer
1
13
SG09DSYG
2009
layer
1
19
SG09HISL1
2009
layer
1
14
SG02393
2002
breeder
1
18
SG08Q207
2008
broiler
1
17
SG09L033
2009
broiler
1
9
SG09YHS28W
2009
layer
1
16
SG02312
2002
layer
4
13
SG02341
2002
layer
1
15
SG02417
2002
layer
9
13
SG02481
2002
layer
2
13
SG02495
2002
layer
11
13
SG04D213
2004
broiler
1
13
SG06Q111
2006
breeder
1
6
A
SG08D440
2008
layer
1
14
10 profiles
SG09L029
2009
broiler
1
14
SG09L049
2009
layer
1
7
ATCC98252
-
-
1
14
/ 20 strains
SG02002
2002
native
4
11
SG02010
2002
broiler
1
13
SG02045
2002
layer
3
23
SG02324
2002
layer
1
19
SG03042
2003
broiler
1
13
SG03128
2003
layer
7
13
SG06D073
2006
layer
6
12
1
SG07D042
2007
layer
1
SG08L026
2008
broiler
1
7
SG04D042
2004
broiler
1
14
SG02388
2002
layer
1
22
SG02157
2002
broiler
2
13
SG03019
2003
layer
8
23
SG07Q015
2004
breeder
1
2
SG04D250
2004
layer
1
4
SG05Q038
2005
broiler
1
20
SG03030
2003
broiler
1
3
287-91
-
-
1
8
B
ATCC9184
-
-
5
21
SG04D198
2004
layer
1
2
C
SG09YHS1W
2009
broiler
1
18
SG08Q435-9R
2008
layer
1
10
SG08Q216-9R
2008
layer
1
10
9R -I
-
-
1
10
9R: 1 profile
9R -K
-
-
1
10
D
SG09KGC-9R
2009
layer
1
10
SG09PHS-9R
2009
layer
1
10
9R -J
-
-
1
10
Fig 1. PFGE(23 pattern)와 MLVA(26 profile)기법의 유전자형 감별 유용성 비교.
Diversity index(DI) : PFGE(0.874), MLVA(0.918).
? SGTR1~SGTR4의 실험실적 안정성을 확인하기 위하여 2개의 균주(SG 287/91 및 SG
06Q110)를 이용하여 30일 동안 매일 계대배양하면서 4개의 SGTR의 변이 여부를 조
사한 결과, SGTR2와 SGTR4는 30회 계대 후에도 변이가 확인되지 않았으며, SGTR1
과 SGTR3은 15회 계대까지는 변이가 확인되지 않았고, 20회 계대후에 변이가 확인
되어, 적어도 실험실에서 이루어지는 통상적인 계대배양하에서는 4개의 SGTR 모두
매우 안정적인 것으로 판단되었음.
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