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3. 표준기술활용사항
표
준
? 가금티푸스균의 유전자형 분석용 MLVA법을 위한 프라이머 염기서열(Table 2) 및
기
multiplex PCR 조건(Table 2, 3, 4 및 Fig 2)
술
활
Table 2. 가금티푸스균 MLVA용 프라이머 염기서열
용
Expected size of
Tandem repeat
Primer (5‘→3’)
amplicon (bp)
6-FAM-CGCCCGTTCGTTACTTTTAC
SGTR1
162-290
GGTTCAACAGGTGGAACAGG
VIC-GCAAAAGCAGGCTGAAGAAG
SGTR2
552-597
AGATCGCCAAGCAGATCGT
NED-CAGCCATCCATACCAAGACC
SGTR3
174-251
CTTTGGGCAGATATCGGAAA
PET-GTGTCATGCCCGAGTCAAC
SGTR4
268-424
GGACGCTGTAATGGACGACT
Table 3. 가금티푸스균 MLVA용 multiplex PCR 반응 혼합물 조성
시 약
첨가량(㎕)
최종농도
물
6.8
5× Taq buffer
5
1×
MgCl2(25mM)
1.5
1.5
dNTPs(10mM)
0.5
0.2
Primer SGTR1-L (10pmol/㎕ = 10μM)
1
0.4μM
Primer SGTR1-R (10pmol/㎕ = 10μM)
1
0.4μM
Primer SGTR2-L (10pmol/㎕ = 10μM)
1.5
0.6μM
Primer SGTR2-R (10pmol/㎕ = 10μM)
1.5
0.6μM
Primer SGTR3-L (10pmol/㎕ = 10μM)
1.5
0.6μM
Primer SGTR3-R (10pmol/㎕ = 10μM)
1.5
0.6μM
Primer SGTR4-R (10pmol/㎕ = 10μM)
1
0.4μM
Primer SGTR4-R (10pmol/㎕ = 10μM)
1
0.4μM
Taq pol(5U/㎕)
0.2
1U
주형 DNA(boiled lysate)
1
합계
25
379

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