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정보구분*
[연구] (병_연구) 썩음병균 Clavibacter 속에 대한 새로운
분류
24.04.12
병
1. 정보현황
수집국가
정보분류**
연구
연구
게시일
22. 09. 15
International Journal of Systematic and Evolutionary
출처명
정보출처
Microbiology 72(9)
https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10
링크
.1099/ijsem.0.005427
2. 주요내용
[연구] (병_연구) 썩음병균 Clavibacter 속에 대한 새로운 분류
Dario Arizala?, Shefali Dobhal, Anne M. Alvarez?, Mohammad Arif
그람
양성균인
클라비박터(Clavibacter)는
현재 7종(Clavibacter
michiganensis,
Clavibacter nebraskensis, Clavibacter capsici, Clavibacter sepedonicus, Clavibacter
tessellarius, Clavibacter insidiosus 및 Clavibacter zhangzhiyongii)과 3개의 아종(C.
michiganensis subsp. californiensis, C. michiganensis subsp chilensis 및 C.
michiganensis subsp. phaseoli)으로 분류됩니다. 최근 연구에 따르면 아종의 분류학적
순위를 재평가해야 합니다. 이 연구에서 우리는 세 가지 C. michiganensis 아종의 분
류학적 위치를 평가하고 다른 75개 Clavibacter 균주의 분류학적 명명법을 명확히 했습
니다. 세 가지 Clavibacter 아종의 유형 균주, C. tessellarius 및 C. nebraskensis
A6096의 유형 균주의 전체 게놈을 PacBio RSII 기술을 사용하여 서열 분석했습니다.
ANI(평균 뉴클레오타이드 동일성), 디지털 DNA-DNA 혼성화, 7가지 하우스키핑 유전자
(acnA, atpD, bipA, icdA, mtlD, recA 및 rpoB)의 다중 유전자좌 서열 분석과 같은 전
체 게놈 기반 컴퓨터 접근 방식의 적용 1?028개 핵심 유전자로부터 재구성된 계통수와
ANI 기반 계통발생은 C. michiganensis subsp. californiensis를 종 수준으로 분류합니
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